Entre 1996-98. Codirigió la programación regular de video y la videoteca del MACBA. En 1994. Programó el ciclo "Malestar en las Ciudades" en el CCCB, y en la Sala Rekalde de Bilbao. Es miembro fundador (desde 1993) de los Archivos OVNI Observatorio de Video No Identificado. www.desorg.org, donde realiza trabajos de investigación, programación y textos críticos : Exodus – Los Márgenes del Imperio. El Sueño Colonial y Zonas Autónomas. Resistencias. Post Sept 11. Comunidades. Identidad vs Mass Media. Noche Oscura del Alma.
La obra de Toni Serra viene marcada por su estrecha relación con el Magreb, incluyendo siempre una idea de la frontera, del límite ya sea geográfico o interior/exterior... También reflexiona sobre la idea del viaje como una búsqueda (siempre sin retorno posible).
Entre los premios recibidos cabe destacar el premio Nam June Paik en la International Media Art Award de 2006.